《财政部国家税务总局关于营改增后契税、 房产税、土地增值税、个人所得税计税依据问题的通知》（财税[2016]43号）第六条   在计征上述税种时，税务机关核定的计税价格或收入不含增值税。

根据上述规定，计征个人所得税时，税务机关核定的计税价格或收入不含增值税。所以，你到税务机关代开发票时，计算个人所得税的计税基础是不包含增值税的。

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